短程之發展目標：

• 成立臨床資訊與醫學統計研究中心：發展臨床醫學研究法及醫學統計於疾病生物標記(Biosignature)、臨床試驗之應用。
• 配合老化整合型計劃之研究：探討右心壓力負荷過度誘發心臟電生理與鈣調控異常機制及治療策略之研究。
• 配合癌症整合型計劃之研究：以affymetrix microarray系統 (SNP 6.0) 探討頭頸部腫瘤之基因變異        (copy number variations)。
• 結合幹細胞和蛋白質体在治療肝臟疾病再生醫學的研究。
• 配合病毒整合型計劃之研究：探討腫瘤病毒特定蛋白質對於病毒複製及致病機轉。
• 肝細胞癌模式中肝癌再復發與循環性體液和細胞因子之探討。

中程之發展目標：

• 配合老化整合型計劃之研究：建立菌血症動物模式，探討心房與心室心律不整之感受性，心臟功能、電生理學作用之變化及治療策略之研究。
• 配合癌症整合型計劃之研究：篩檢並探討頭頸部腫瘤之基因變異 (copy number variations)之臨床意義。
• 配合病毒整合型計劃之研究：連結卡波西式病毒蛋白質間的功能分析。
• 臨床資訊與醫學統計研究中心：追蹤並完成那些經由驗證過的口腔鱗狀上皮細胞癌(oral squamous cell carcinoma，OSCC)生物標記之成果評估，以建立未來成本效益分析之直接比較；最終能以此改善OSCC病人之治療結果，並同時減輕醫療成本之負擔。
• 建立一個有效的光線治療法調控肝臟發炎，纖維化和移植後排斥。

長程之發展目標：

• 擴大研究中心與未來醫院之臨床試驗中心，癌症中心及轉譯中心之合作，提供研究方法學之理論供給與實務之應用。
• 配合老化整合型計劃之研究：以心肌梗塞誘發心衰竭模式，探討心臟電生理異常之離子機制。
• 配合癌症整合型計劃之研究，發展頭頸部腫瘤之基因變異 (copy number variations) 之 stratification markers (recurrence or metastasis)。
• 配合病毒整合型計劃之研究，建立腫瘤病毒致病模式及利用病毒特性應用於治療或基因治療應用。
• 肝臟移植排斥與肝癌再復發生物標記開發。